*Result*: Webová aplikace pro kontextové vyhledávání a vizualizaci transkriptomických dat rostlin ; Web application for contextual search and visualization of plant transcriptomics data

Title:
Webová aplikace pro kontextové vyhledávání a vizualizaci transkriptomických dat rostlin ; Web application for contextual search and visualization of plant transcriptomics data
Authors:
Contributors:
Petrášek Jan, Novák Jiří
Publisher Information:
České vysoké učení technické v Praze. Vypočetní a informační centrum.
Czech Technical University in Prague. Computing and Information Centre.
Publication Year:
2025
Collection:
Czech Technical University in Prague: Digital Library / České vysoké učení technické v Praze: Digitální knihovna ČVUT
Document Type:
*Dissertation/ Thesis* bachelor thesis
File Description:
application/pdf; application/octet-stream
Language:
unknown
Rights:
A university thesis is a work protected by the Copyright Act. Extracts, copies and transcripts of the thesis are allowed for personal use only and at one?s own expense. The use of thesis should be in compliance with the Copyright Act http://www.mkcr.cz/assets/autorske-pravo/01-3982006.pdf and the citation ethics http://knihovny.cvut.cz/vychova/vskp.html ; Vysokoškolská závěrečná práce je dílo chráněné autorským zákonem. Je možné pořizovat z něj na své náklady a pro svoji osobní potřebu výpisy, opisy a rozmnoženiny. Jeho využití musí být v souladu s autorským zákonem http://www.mkcr.cz/assets/autorske-pravo/01-3982006.pdf a citační etikou http://knihovny.cvut.cz/vychova/vskp.html
Accession Number:
edsbas.207670D2
Database:
BASE

*Further Information*

*Tato práce je zaměřena na vypracování a testování webové aplikace, která zlepšuje proces analýzy rostlinných transkriptomických dat. Rešeršní část práce se věnuje vysvětlení problematiky analýzy transkripce rostlin, získávání transkriptomických dat z experimentů a jejich zpracování a interpretace v podobě grafických výstupů. Jsou také představeny nástroje, které jsou momentálně využívány k řešení podobných zadaní. Tyto nástroje však postrádají flexibilitu a uživatelskou kontrolu nad daty, proto proto byla navržena a implementována vhodná webová aplikace, skládající se z databáze, webového serveru s aplikačním rozhraním REST a klientské aplikace, jež toto rozhraní využívá. Závěr práce je věnován testování uživatelského rozhraní a nasazení aplikace pro lokální testování. ; This thesis focuses on the development and testing of a web application that improves the process of analysing plant transcriptomic data. The review part of the thesis is devoted to explaining the problems of plant transcription analysis, extracting transcriptomic data from experiments, and processing and interpreting the data as graphical output. Tools currently used for similar tasks are also presented. Since tools currently available lack required flexibility and control, a suitable web application is designed and implemented, consisting of a database, a web server with a REST application interface and a client application using this interface. Finally, testing of the application user interface was conducted as well as deployment preparation for a local testing.*